1、公允的關聯交易與非公允的關聯交易

公允的關聯交易，是指一個具體關聯交易的實質內容主要是交易結果，對交易的相關權益人特別是交易所涉及的非關聯方，都是公平合理的。

非公允的關聯交易，是指一個具體關聯交易的實質內容主要是交易結果實質上是不公平的，有損于交易的相關權益人特別是交易所涉及的非關聯方的權益。

這是最常見的分類，因為非公允性是關聯交易最容易出現的問題，也是法律規制關聯交易的原因與重點。一方面要保證公允關聯交易積極作用的發揮，另一方面要讓非公允關聯交易者承擔一定的法律責任，并為受害者提供一定的救濟。

2、實際的關聯交易與虛構的關聯交易

實際的關聯交易，是指在經濟生活或者企業的經營活動中，確實發生了關聯交易。

虛構的關聯交易，是指在在經濟生活或者企業的經營活動中并未實際發生而只是虛構文件并在企業財務報表中有記載的關聯交易。

如此區分的主要意義，在于對會計報表進行調校。實際當中，有的公司為了粉飾業績，虛構出一些實際并未發生的關聯交易，也就是缺乏經濟實質的交易。

3、重大的關聯交易與非重大的關聯交易

這種區分一般是以交易金額為判斷標準的，其主要目的是為了在進行關聯交易的披露、批準時參照不同的要求。如零星的關聯交易可以不經股東大會批準程序，且有的零星關聯交易不需要披露;再如，上市公司對普通關聯交易和重大關聯交易的披露要求也不相同。